Основания

 
+
-
edit
 
KUZNETS>Плохо я в этом разбираюсь...
KUZNETS>Кажется, оснований всего 4 - А,Ц,Т,Г. А почему именно 4? :)
Вернее ПЯТЬ :)
Аденин-Гуанин, Цитозин-Тимин-Урацил.
А насчет у кого спросить, почему так? В церковь(синагогу, мечеть,пагоду) чаще ходи :)

Ник
Объективная реальность - вариант бреда, обычно вызывается низким уровнем концентрации алкоголя в крови.
 

Darth

опытный

> В церковь(синагогу, мечеть,пагоду) чаще ходи

Вот как раз там-то Вам об этом расскажут с наименьшей вероятностью :)
 
+
-
edit
 
>> В церковь(синагогу, мечеть,пагоду) чаще ходи

Darth>Вот как раз там-то Вам об этом расскажут с наименьшей вероятностью :)

А там спрашивать ничего не надо. Само прейдет :)

Ник
Объективная реальность - вариант бреда, обычно вызывается низким уровнем концентрации алкоголя в крови.
 
+
-
edit
 

KUZNETS
Kuznets

Клерк-старожил

Плохо я в этом разбираюсь...
Кажется, оснований всего 4 - А,Ц,Т,Г. А почему именно 4? :)
 
+
-
edit
 

k_gornik

втянувшийся

KUZNETS>Плохо я в этом разбираюсь...
KUZNETS>Кажется, оснований всего 4 - А,Ц,Т,Г. А почему именно 4? :)

Ну, нам надо обеспечить кодирование тридцати с чем-то аминокислот. Число оснований должно быть четным, они взаимно дополнительны. Система должна быть максимально простой, она порождена доволжно-таки случайным процессом. Если бы было два основания, аминокислоты кодировались бы не триплетами, а более длинными кусками ДНК. Это усложняет систему. 4 - оптимум простоты и жизнеспособности.
 
RU CaRRibeaN #15.01.2002 18:39
+
-
edit
 

CaRRibeaN

координатор

k_gornik>Ну, нам надо обеспечить кодирование тридцати с чем-то аминокислот.

Все-таки двадцити (одной). Насчет 21 у меня смутные сомнения.

Кстати код из 4 оснований (точнее 4 комплементарных пар) кодирует 64 "аминокислоты", точнее триплет-кодонов, каждые несколько из которых соотвествуют одной аминокислоте. Плюс там есть стартовый и стоповый би... эээ кодон. ВОобще мухлюет матушка природа - на такой вырожденном коде запросто можно было организовать сжатие :) Первые 21 траплета кодирую аминокислоты, потом два триплета системных, а оставшаеся 41 - самые распространенные сочетания пар аминокислот :D
Shadows of Invasion.  
+
-
edit
 
CaRRibeaN>Все-таки двадцити (одной). Насчет 21 у меня смутные сомнения.
Тридцать ближе - это у человека (и многих млекопитающих)20.

CaRRibeaN>....ВОобще мухлюет матушка природа - на такой вырожденном коде запросто можно было организовать сжатие :) Первые 21 траплета кодирую аминокислоты, потом два триплета системных, а оставшаеся 41 - самые распространенные сочетания пар аминокислот :D
Зачем? ДНК занимает в клетке мизерный объем, можно с любой избыточностью. А вот ВРЕМЯ на декодедирование -ресурс ограниченный. Вы же не сжимаете txt чтоб место на 30 Гб диске освободить :) А модемов Природа (хм..ну да ладно :) ) РАЗУМНО не предусмотрела :D
Ник
Объективная реальность - вариант бреда, обычно вызывается низким уровнем концентрации алкоголя в крови.
 
RU CaRRibeaN #15.01.2002 19:16
+
-
edit
 

CaRRibeaN

координатор

Nick_Crack>А вот ВРЕМЯ на декодедирование -ресурс ограниченный. Вы же не сжимаете txt чтоб место на 30 Гб диске освободить

Мда. Вообще-то говоря в клетке не ДСП стоит. Насколько я помню работает следующий механизм - есть специальные молекулы (уже не транспортные ли РНК? Где Зверь с Vale) которые одним боком цепляються к информационной РНК - к соответсвующему кодону, а другим концом на эту молекулу вешаеться соответсвующяя аминокислота. Этот комплекс протаскиваеться сквозь рибосому и из аминокислот сшиваеться белок, попутно отцепляються т-РНК (если это они).

Какие проблемы были вешать на т-РНК 2 аминокислоты?

Впрочем это во мне программер говорит, неоптимальности вижу :) М.б. я не знаю чего.

Кстати схема с сжатием работает быстрее по идее... хотя нет, помоему эти т-РНК сразу все цепляються к и-РНК, а не последовательно, так что сэкономить не удалось бы.
Shadows of Invasion.  
+
-
edit
 

Kuznets

Клерк-старожил

k_gornik>Система должна быть максимально простой, она порождена доволжно-таки случайным процессом.

Вопрос у меня еще и в том, единственный ли это вариант (скажем, по химическим свойствам) или результат отбора.
 
+
-
edit
 

Kuznets

Клерк-старожил

KUZNETS>>Кажется, оснований всего 4 - А,Ц,Т,Г. А почему именно 4? :)
Nick_Crak>Вернее ПЯТЬ :)
Nick_Crak>Аденин-Гуанин, Цитозин-Тимин-Урацил.

Урацил по-моему не в ДНК, а в РНК или еще где, так?

Nick_Crak>А насчет у кого спросить, почему так? В церковь(синагогу, мечеть,пагоду) чаще ходи :)

Слабоваты они в этом вопросе...
 
+
-
edit
 
KUZNETS>>Урацил по-моему не в ДНК, а в РНК или еще где, так?

Nick_Crak>В РНК -но это не играет роли. Просто ОСНОВАНИЙ играющих информационную роль -пять, а не четыре :)

Потому он и в РНК, дабы на аналоговом уровне отличить РНК от ветви ДНК.

Т.е. выполняет роль того самого "системного" заголовка.
 
+
-
edit
 
yuu2>Потому он(урацил-прим.мой) и в РНК, дабы на аналоговом уровне отличить РНК от ветви ДНК.

yuu2>Т.е. выполняет роль того самого "системного" заголовка.

Хм, свежий взгляд! :) Но вообщето это связанно, по моему, с химизмом процессов в рибосомах(или где то ...?).

Ник
Объективная реальность - вариант бреда, обычно вызывается низким уровнем концентрации алкоголя в крови.
 
+
-
edit
 

Kuznets

Клерк-старожил

KUZNETS>>Урацил по-моему не в ДНК, а в РНК или еще где, так?
Nick_Crak>В РНК

Вместо цитозина или тимина?
 
+
-
edit
 
Nick_Crak>Хм, свежий взгляд! :)

Что вынес из школы :) - тому и нашёл подходящую аналогию.

Nick_Crak>Но вообщето это связанно, по моему, с химизмом процессов в рибосомах(или где то ...?).

А это уже из разряда "курица или яйцо". Либо потребность аналогового опознания/отделения РНК от свободной ветви ДНК породила дополнительный пятый компонент как регулятор последующего "различного химизма", либо "различный химизм" привёл к структурным отличиям ДНК и РНК.

Но для каждой из них по-отдельности информационных носителей - четыре.
 
Вызывали?

Мажорных (т.е. составляющих основную часть) оснований действительно 4 - A, G, C и (T или U).

>А почему именно 4?
Вопрос не имеет смысла. Потому что потому ;) . "Так природа захотела, почему -не наше дело, для чего - не нам судить". (с) Окуджава.

Если исходить из реалий нашей жизни - то такой системы достаточно для того, чтобы были 2 пары оснований - крепко связанные - G-C и слабо A-T. И можно было бы отличать РНК не по сахарам, а по основаниям (U). Но никто не может гарантировать, что это единственная возможная система.

Вообще - то на эту тему наверняка можно найти и в Инете информацию. Не говоря уж о библиотеке...
Смотри учебники биохимии. Скажем, А. Спирина.

>Ну, нам надо обеспечить кодирование тридцати с чем-то аминокислот
ДВАДЦАТИ. Еще 2-3 "стоп" кодона, и один кодон "начало"(формил метионин, только у бактерий, насколько я помню).

Вырожденность кода возникает из-за того, что реально третье основание распознаётся "халявно". Чтобы не сказать "очень халявно".

Кстати, у человека КОДИРУЮЩИЕ и регуляторные последовательности вместе, насколько я помню, занимают процентов то ли 10, то ли 5, то ли 2 от общего объёма генома. И многие гены бывают в нескольких копиях.
А у некоторых вирусов одна и та же последовательность может читаться в двух разных направлениях(частично). Им важнее место в вирионе экономить.

Вообще, будьте осторожны с применением в биологии компьютерных/инженерных аналогий. Легко грубую ошибку сделать.
 
+
-
edit
 
Vale>Вообще, будьте осторожны с применением в биологии компьютерных/инженерных аналогий. Легко грубую ошибку сделать.

И про термодинамические не забывайте !!!! :lol::lol::lol:

Ник

P.S.Оснований все же пять :) А вот кодирующих пар - 2е ;)
Объективная реальность - вариант бреда, обычно вызывается низким уровнем концентрации алкоголя в крови.
 
+
-
edit
 

varban

администратор
★★★
Вот нормальное (по первоначалу) обсуждение!
Одно из немногих биологических!
Только мне переведите спор опять в теологическую плоскость :mad: Помните, что стояло в углу кабинета Кристобала Хозевича?
:D:D:D
 
+
-
edit
 
varban>Помните, что стояло в углу кабинета Кристобала Хозевича?
varban> :D:D:D
Varban?ну как можно! Я даже стал применять слово "Природа"! :) Только тссс..пока никто ничего не заметил...
Молчу, молчу.. :)

Ник

P.S.У меня тоже есть таксидермист хороший :) Я б разместил фотки- там такие совы и орлы есть!
Кстати, насчет фоток - у меня есть чертежи к "ПуВРД". может я тебе пошлю, а ты их раcставишь?
Объективная реальность - вариант бреда, обычно вызывается низким уровнем концентрации алкоголя в крови.
 
+
-
edit
 

varban

администратор
★★★
Почему никто не заметил?
Я заметил :)
Одобряю :)

Чертежи шли :)
 
+
-
edit
 
KUZNETS>Урацил по-моему не в ДНК, а в РНК или еще где, так?

В РНК -но это не играет роли. Просто ОСНОВАНИЙ играющих информационную роль -пять, а не четыре :)

Nick_Crak>>А насчет у кого спросить, почему так? В церковь(синагогу, мечеть,пагоду) чаще ходи :)

KUZNETS>Слабоваты они в этом вопросе...
Предоложение снято. Понял. :)

Ник
Объективная реальность - вариант бреда, обычно вызывается низким уровнем концентрации алкоголя в крови.
 
+
-
edit
 

Lunohod

втянувшийся

Vale>Вырожденность кода возникает из-за того, что реально третье основание распознаётся "халявно". Чтобы не сказать "очень халявно".

Eще надо не забывать про самокорректировку кода и про устойчивость к нарушениям в коде... В этом смысле избыточность может быть весьма полезной.
 
Что имеется в виду под самокорректировкой кода?
К количеству оснований никакого отношения репарация (если речь о ней) не имеет. Их могло бы быть и 2 и 6. Любое чётное число.
Это следствие комплементарности спиралей.
 
US Зверь #19.01.2002 09:49
+
-
edit
 

Зверь

опытный

Можно сказать что оснований всего четыре, поскольку урацил это ничто иное как метилированный урацил, а метилирование, ацетилирование и фосфорилирование как и деметилирование де.... очень распространенные процессы в клетке.
 
+
-
edit
 

Lunohod

втянувшийся

Vale>Что имеется в виду под самокорректировкой кода?
Это было продолжение программистских шуточек про избыточность кода, неоптимальность и т.п. :)
 
+
-
edit
 

Kuznets

Клерк-старожил

Зверь>поскольку урацил это ничто иное как метилированный урацил,

Недопонял...
 

в начало страницы | новое
 
Поиск
Настройки
Твиттер сайта
Статистика
Рейтинг@Mail.ru