Например структура на xml, данные в формате json
оптимизатор - встроенное файловое кэширование ОС и memcache
Сам движок вставки, удаления, изменения, блокировки, sql-подобной выборки - задачка для студента 1 курса.
Что вижу в плюсах - на порядок более высокое быстродействие, на порядок меньше требования к ресурсам сервера, легкость масштабирования, бэкапов, распределения базы по разным хранилищам на лету
Что вижу в минусах - сложность в поддержке сторонними специалистами, необходимость недельку поработать, в то время как сервера sql уже готовы.
Да, речь идет о сравнительно крупных проектах, с примерно несколькими сотнями тысяч запросов в сутки.