Y.K.> У устройства захвата отдельные звуковые входы.
Речь о выходах
Y.K.> Хотя выход один - USB
USB — это шина. На одном соединении может весеть уйма устройств.
Y.K.> Когда захватываю в VLC, указываю отдельно устройства видео /dev/video1 и звуковое hw:1,0
Вот, скорее всего, звуковым входом устройство прикидывается отдельным.
Y.K.> А если раздельно захватывать - появятся ба-альшие проблемы с синхронизацией...
По идее, никаких не должно быть. Указываешь ffmpeg'у брать видео с одного канала, звук — с другого. А сводить в конечное видео он будет то, что в это время идёт с указанных источников в реальном времени.