Встанет нормально.
Могут быть проблемы, если БП и корпус - чистый ATX, а материнка от ATX 2.03 (если не ошибаюсь с индексом), то есть P4 (особенно первые, без обычного 5.25" коннектора и с креплением радиатора кулера к шасси).
Впрочем, вряд ли такую бы отдали просто так.
PS Ну а если в воспоминания удариться, то я тут как-то в AT'шный десктоп впихал мамку (Acer по-моему, не помню точно, давно валяется где-то в закромах) формата LPX вместе с райзером. И всего-то понадобилась дрель, напильник, пила по металлу, кусок дерева, шурупы, немного фантазии и пачка канцелярских резинок для крепления всего того, что не удалось закрепить вышеозначенными средствами.
Хотя потом пришлось ещё пофантазировать на предмет крепления винта и флопповода - отсеки 3,5", конечно, конструкцией не предусматривались.
Довершили конструкцию степлер, скотч и картон, закрывшие все образовавшиеся лишние дыры. На процессор пришпилил нестандартный кулер (после того, как обжёгся об радиатор этой четвёрки), после недолгих извращений удалось и заставить гореть лампочки на передней панели - разъёмы для них также не предусматривались.
Корпус сохранил совместимость и с обычным железом.
Жалко, фотографий чуда не осталось.
Потом ещё был случай - впихивал 386-ю в некомплектный XT-шный корпус. Понятное дело, переделать крепление БП, поставить внешний выключатель, изобрести подходящую конструкцию для крепления материнки.
Это я всё к чему? А к тому, что если что-то куда-то не лезет, то это надо туда впихать.